More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4841 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  51.39 
 
 		 292 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  50.69 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  35.74 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  37.54 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  39.38 
 
 		 295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  38.25 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  38.6 
 
 		 303 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  38.19 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  37.72 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  37.68 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  35.56 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.22 
 
 		 303 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  34.97 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 290 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.45 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 292 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 292 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 287 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 290 aa  135  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  29.54 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.99 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  32.91 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>