More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1838 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  85.95 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  85.95 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  85.95 
 
 		 306 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  85.62 
 
 		 306 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  84.64 
 
 		 390 aa  551  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  84.31 
 
 		 306 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  84.31 
 
 		 306 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  84.31 
 
 		 306 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  84.31 
 
 		 306 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  84.31 
 
 		 306 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  83.66 
 
 		 390 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  74.59 
 
 		 305 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  74.92 
 
 		 305 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  72.85 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  54.11 
 
 		 303 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  50.99 
 
 		 304 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  49.66 
 
 		 304 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  50.66 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  50.84 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.19 
 
 		 304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  46.51 
 
 		 304 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  46.51 
 
 		 304 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  47.14 
 
 		 301 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  46.46 
 
 		 301 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  46.58 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  45.79 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  43.14 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  45.21 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  45.48 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.08 
 
 		 310 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  41.14 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  41.28 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  43.15 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  40.67 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  42.12 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.86 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  37.04 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  36.7 
 
 		 297 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  37.09 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  36.86 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  32.67 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.38 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.38 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.68 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.31 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.04 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.36 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.39 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  31.2 
 
 		 292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  30.99 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  33.64 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.27 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.15 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  32.2 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  29.29 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.13 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.92 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.92 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  32.02 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.05 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>