More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3063 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  100 
 
 		 303 aa  630  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  76.24 
 
 		 303 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  75.58 
 
 		 303 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  76.24 
 
 		 303 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  68 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  67.22 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  66.22 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  63.25 
 
 		 303 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  62.46 
 
 		 301 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  57 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  43.43 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  40.61 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  35.84 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  36.11 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  36.46 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 292 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.23 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  30.28 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.9 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  31.63 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  30.94 
 
 		 295 aa  133  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.36 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  30.85 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.18 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  31.42 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  30.22 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31.32 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  31.71 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.7 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  29.33 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  29.05 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>