More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5758 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  84.07 
 
 		 295 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  45.05 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  44.9 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  45.92 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  46.44 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  47.02 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  43.43 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  44.97 
 
 		 302 aa  248  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  44.33 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  41.69 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  43.05 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  43.16 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  41.75 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  38.44 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  34.03 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 319 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  30.21 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.16 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 291 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.15 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  35.68 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.52 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.15 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  34.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  34.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  34.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  34.16 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.16 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  34.38 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  33.45 
 
 		 390 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  33.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  33.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  33.45 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  31.03 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.51 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0646  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>