More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1372 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  80.47 
 
 
302 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  72 
 
 
303 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  71.67 
 
 
303 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  71.67 
 
 
303 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  71 
 
 
303 aa  437  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  68 
 
 
303 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  67.68 
 
 
297 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  63.76 
 
 
301 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  59.27 
 
 
305 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  44.97 
 
 
295 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  41.84 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  37.16 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  38.49 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  38.14 
 
 
292 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 
298 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 
298 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 
298 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 
298 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 
292 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 
298 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 
295 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
294 aa  142  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  33.68 
 
 
298 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 
293 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  31.94 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 
298 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.52 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 
298 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 
291 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 
292 aa  132  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.67 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
298 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0033  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 
289 aa  130  4.0000000000000003e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
298 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 
302 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.55 
 
 
295 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 
303 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 
298 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.51 
 
 
304 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.72 
 
 
298 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  29.1 
 
 
305 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
304 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  31.11 
 
 
293 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 
292 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 
291 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
289 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.27 
 
 
304 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.24 
 
 
296 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 
296 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 
304 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 
289 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.55 
 
 
295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
288 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.21 
 
 
295 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31.32 
 
 
292 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 
291 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
298 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>