More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2111 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 302 aa  620  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  80.47 
 
 		 302 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  72.91 
 
 		 303 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  72.91 
 
 		 303 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  74.65 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  73.09 
 
 		 303 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  67.22 
 
 		 303 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  70.03 
 
 		 297 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  61.79 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  58.19 
 
 		 305 aa  362  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  43.05 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  41.78 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  34.68 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  35.86 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 298 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  32.07 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.61 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 		 294 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.97 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 291 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.12 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.07 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  28.12 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.61 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.82 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.21 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.99 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  30.41 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  27.76 
 
 		 302 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.41 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  29.76 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  32.24 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  28.87 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>