More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1217 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
293 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  39.38 
 
 
292 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  38.01 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  37.2 
 
 
303 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  38.44 
 
 
295 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  36.18 
 
 
303 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  39.12 
 
 
295 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.84 
 
 
303 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 
292 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  37.16 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 
303 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 
305 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 
303 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  34.95 
 
 
297 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  34.68 
 
 
302 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 
301 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  34.58 
 
 
294 aa  175  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  35.27 
 
 
291 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.89 
 
 
291 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 
313 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  36.69 
 
 
287 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 
293 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.89 
 
 
291 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 
290 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 
296 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 
290 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
292 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 
290 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 
292 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 
295 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 
292 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  34.52 
 
 
291 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
295 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
295 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 
291 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.6 
 
 
290 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 
295 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 
303 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 
304 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 
294 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  31.89 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
307 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 
292 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 
294 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
308 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.4 
 
 
304 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 
297 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 
297 aa  149  5e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 
292 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 
292 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 
304 aa  148  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  33.88 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 
295 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 
294 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 
300 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.33 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 
292 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 
295 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 
305 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  32.65 
 
 
307 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 
302 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.62 
 
 
301 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 
292 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  36.25 
 
 
293 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 
298 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.92 
 
 
308 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 
298 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
289 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 
332 aa  143  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  34.68 
 
 
296 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 
289 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
308 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 
292 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 
293 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  32.37 
 
 
307 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 
295 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 
295 aa  142  6e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
292 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>