More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1307 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 293 aa  594  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  77.74 
 
 		 293 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  77.93 
 
 		 293 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  68.17 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  68.04 
 
 		 295 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  67.82 
 
 		 295 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  71.28 
 
 		 294 aa  387  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  65.52 
 
 		 298 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  66.44 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  65.74 
 
 		 298 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  65.4 
 
 		 298 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  65.05 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  62.5 
 
 		 297 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  65.65 
 
 		 298 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  57.14 
 
 		 290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  53.82 
 
 		 296 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 298 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  36.9 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  34.25 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 294 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  34.25 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.76 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 305 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.94 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  31.33 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.91 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.93 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.08 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  32.19 
 
 		 297 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  32.88 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  36.2 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  33.91 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 289 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>