More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4834 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 303 aa  628  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  94.72 
 
 		 303 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  90.43 
 
 		 303 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  76.24 
 
 		 303 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  71.67 
 
 		 302 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  72.91 
 
 		 302 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  66.89 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  67.23 
 
 		 297 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  65.45 
 
 		 301 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  58 
 
 		 305 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  45.92 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  45.05 
 
 		 295 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  37.63 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  37.2 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  37.98 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  35.81 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.12 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.83 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  32.87 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.15 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.01 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 307 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.83 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  29.97 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  32.06 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.31 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.45 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.76 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.39 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.98 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  30.95 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.1 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>