More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1531 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  83.22 
 
 		 304 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  82.89 
 
 		 304 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  82.89 
 
 		 304 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  64.14 
 
 		 304 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  61.51 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  53.9 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  50 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  52.4 
 
 		 306 aa  315  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 305 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  46.18 
 
 		 309 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  46.51 
 
 		 306 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  51.7 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.51 
 
 		 390 aa  299  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.18 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.18 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  45.18 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.18 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  45.18 
 
 		 306 aa  298  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  46.36 
 
 		 305 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  46.36 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  44.85 
 
 		 390 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  45.51 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  45.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  45.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  45.51 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  47.12 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  48.31 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  48.31 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  47.3 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  45.51 
 
 		 304 aa  281  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  45.08 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  45.03 
 
 		 304 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  43.3 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.33 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  43.92 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  45 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  40.89 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  42.96 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  38.27 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  35.86 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  35.84 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  34.04 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  30.58 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.93 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  30.32 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  34.14 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  35.38 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.78 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 292 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.74 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.09 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  30.72 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  32.4 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  31.23 
 
 		 303 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.58 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.24 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.11 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>