More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4753 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 305 aa  623  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  66.67 
 
 		 301 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  60.33 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  59.27 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  59.33 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  58 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  57 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  58.59 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  58.8 
 
 		 303 aa  351  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2111  dihydrodipicolinate synthase  58.19 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000964541  normal  0.786105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  42.57 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  41.69 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  41.18 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  41.18 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  33.67 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  38.19 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  35.89 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  32.31 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  36.4 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  34.25 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.9 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  31.64 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.18 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  33.9 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.28 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  35.14 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  35.4 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.23 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  36.12 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  36.12 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.93 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.43 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 319 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  34.44 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>