More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0297 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  69.8 
 
 
303 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  52.4 
 
 
304 aa  321  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  54.79 
 
 
304 aa  317  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.4 
 
 
304 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  50.84 
 
 
306 aa  311  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  51.03 
 
 
304 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  51.96 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  50.84 
 
 
309 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  50.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  50.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50.84 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50.17 
 
 
390 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  50.5 
 
 
390 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47 
 
 
304 aa  285  7e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.83 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.49 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  49.83 
 
 
304 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  50.68 
 
 
305 aa  275  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  45.97 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  46.31 
 
 
301 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  42.76 
 
 
304 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 
301 aa  258  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.78 
 
 
310 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  44.44 
 
 
304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  42.57 
 
 
304 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  40.92 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  42.33 
 
 
304 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  46.18 
 
 
300 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 
302 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  46.62 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  42.42 
 
 
304 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  34.71 
 
 
295 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  37.64 
 
 
310 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.78 
 
 
297 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  34.42 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  36.33 
 
 
307 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 
298 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  34.31 
 
 
295 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  34.6 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.74 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.21 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  36.48 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
298 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
298 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 
291 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
290 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 
298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 
291 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.6 
 
 
298 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  36.59 
 
 
304 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.6 
 
 
298 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 
298 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 
297 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.88 
 
 
298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 
292 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.87 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 
289 aa  136  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 
292 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 
298 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 
288 aa  135  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  30.86 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 
292 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 
291 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 
293 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  36.02 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  33.58 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.93 
 
 
313 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>