More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1479 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  63.27 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  61.07 
 
 		 304 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  52.35 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  52.53 
 
 		 301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  51.52 
 
 		 301 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  51.02 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  51.02 
 
 		 301 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  44.56 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  48.64 
 
 		 304 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  44.41 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  46.23 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45.08 
 
 		 304 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  44.26 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  46.02 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  43.39 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  43.39 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  42.37 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  48.12 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  42.38 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  42.57 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  40.92 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  40.92 
 
 		 305 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  40.67 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  40.59 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40 
 
 		 390 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  43.77 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  39 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  38.67 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  39.67 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  34.53 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  34.05 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  34.01 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  33.47 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.15 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  30.48 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  30.34 
 
 		 303 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0658  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.73 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 298 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  27.46 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.73 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  29.44 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  31.94 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  25.96 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  34.18 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  31.32 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.62 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  25.34 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  29.27 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  30.15 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  29.2 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>