More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6005 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  70.21 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  52.44 
 
 		 310 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  51.74 
 
 		 310 aa  289  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  52.76 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  47.52 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  41.89 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  41.03 
 
 		 304 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  35.42 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 304 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  42.8 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  41.36 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.86 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  40.14 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  38.19 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.81 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  36.7 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  36.52 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  36.61 
 
 		 306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  36.33 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  37.15 
 
 		 390 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  39.1 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.93 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.93 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  35.93 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.93 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  36.68 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  36.46 
 
 		 390 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  36.11 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  38.78 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.64 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.29 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  38.54 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  35.64 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.86 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  34.38 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  34.01 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.5 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  32.07 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  33.69 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.58 
 
 		 298 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.5 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.39 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.36 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.23 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  32.25 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.96 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>