More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2503 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  62.91 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  48.34 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  46.67 
 
 		 304 aa  262  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  49.5 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  46.51 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  45 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  46.18 
 
 		 301 aa  248  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  46.51 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  45.45 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  46.67 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  43.77 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  41.67 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  47.35 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  41.67 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  41.08 
 
 		 304 aa  224  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  42.09 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  42.19 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  40.74 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  40.67 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  40.26 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  39.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  39.6 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  40 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  39.27 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  39.27 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  39.27 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  39.27 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  42.03 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  42.42 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  41.89 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  41.39 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  42.33 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  37.58 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  39.64 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  37.84 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  37.99 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 295 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  31.08 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  29.15 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  30.85 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.76 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.44 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.42 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  31.77 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.75 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.13 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.01 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.97 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  31.94 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31640  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  32.48 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  31.01 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.65 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.42 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  24.67 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>