More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2714 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 304 aa  623  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  51.85 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  55.7 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  55.03 
 
 		 305 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  53.77 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  54.92 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  54.58 
 
 		 301 aa  321  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  51.19 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 304 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  52.4 
 
 		 304 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  50 
 
 		 304 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  54.79 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  49.66 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 304 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  52.4 
 
 		 304 aa  315  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  52.38 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  51.19 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  48.98 
 
 		 309 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  47.96 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  47.96 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  47.96 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  47.96 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  47.96 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  48.3 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  48.3 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  48.3 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  48.3 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  48.3 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  48.3 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.64 
 
 		 305 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  48.64 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  51.02 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  51.17 
 
 		 304 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  48.98 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  46.6 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  46.28 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  49.5 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  47.93 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3517  dihydrodipicolinate synthetase  48.81 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6005  dihydrodipicolinate synthase family protein  41.03 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0175155  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  39.93 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5916  dihydrodipicolinate synthetase  41.3 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0538194  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4723  dihydrodipicolinate synthetase  37.18 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4110  dihydrodipicolinate synthetase  38.52 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  36.5 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  36.13 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.56 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.06 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.76 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 		 298 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.28 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  33.09 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  36.09 
 
 		 303 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31640  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  33.69 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  31.21 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.83 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  32.99 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 291 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  31.99 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.3 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  28.88 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  32.74 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  32.74 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.41 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  31.69 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.36 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>