More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3706 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  97.97 
 
 		 295 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  94.24 
 
 		 295 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  70.65 
 
 		 293 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  70.14 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  67.82 
 
 		 293 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  64.71 
 
 		 294 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  60.14 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 298 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  57.24 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  59.79 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  54.42 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  58.08 
 
 		 298 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  51.4 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  52.07 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  46.34 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 298 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  34.27 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  34.27 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.47 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  34.31 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.25 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.72 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  34.33 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  29.47 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  35.21 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  32.26 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  29.93 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 298 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.12 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  33.9 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  35.19 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.53 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.66 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  33.46 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  32.5 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>