More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0921 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 295 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  64.24 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  64.93 
 
 		 298 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  36.77 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  40.42 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  40.14 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  32.65 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  39.31 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  39.13 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  36.65 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  39.13 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  37.08 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  38.01 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  38.01 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  38.04 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  37.14 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  38.05 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  39.35 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  34.64 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  34.77 
 
 		 293 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  34.49 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  34.04 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  36.05 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  34.43 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  35.48 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  37.5 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  36.43 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  34.11 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  36.23 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  36.25 
 
 		 296 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  35.98 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  38.53 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  35.74 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  36.25 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  36.25 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.66 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  36.07 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 320 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  35.16 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  36.12 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  34.59 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>