More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0452 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
296 aa  594  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  54.33 
 
 
290 aa  331  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  58.39 
 
 
298 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  53.82 
 
 
293 aa  328  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  57.49 
 
 
298 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  57.44 
 
 
297 aa  324  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  57.14 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  57.14 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  57.69 
 
 
298 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  57.14 
 
 
298 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  57.49 
 
 
298 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  57.14 
 
 
298 aa  314  9e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  54.55 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  53.29 
 
 
293 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  52.76 
 
 
295 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  52.41 
 
 
295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  52.07 
 
 
295 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  52.1 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  49.82 
 
 
299 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 
298 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 
298 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 
298 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 
298 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 
298 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 
298 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 
298 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 
298 aa  175  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  36.21 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  34.52 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  38.81 
 
 
295 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
297 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  35.42 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.38 
 
 
291 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
299 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  33.45 
 
 
295 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 
290 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 
291 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 
294 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 
294 aa  155  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  32.5 
 
 
297 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 
292 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 
304 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  35.66 
 
 
294 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 
300 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.63 
 
 
304 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 
300 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
291 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
292 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.12 
 
 
294 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 
291 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.23 
 
 
294 aa  149  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 
302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  34.14 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
295 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.3 
 
 
313 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 
313 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
293 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  31 
 
 
309 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 
294 aa  143  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.22 
 
 
288 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  26.57 
 
 
289 aa  143  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  34.8 
 
 
296 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 
291 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.83 
 
 
297 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 
289 aa  142  7e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 
296 aa  142  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  32.03 
 
 
305 aa  142  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 
291 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 
293 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  32.76 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 
293 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  32.27 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>