More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4167 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 296 aa  587  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  67.25 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  61.32 
 
 		 308 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  62.59 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  64.24 
 
 		 308 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  57.43 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  58.78 
 
 		 297 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  61.34 
 
 		 295 aa  297  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  58.64 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  53.72 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  45.12 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  46.44 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  48.83 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  37.33 
 
 		 559 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  41 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  34.51 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.55 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.55 
 
 		 294 aa  139  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  34.8 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  34.47 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  31.7 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  34.33 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  35.48 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  36.75 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 292 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  32.01 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  31.65 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  36.4 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.28 
 
 		 297 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  34.24 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.17 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.69 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  36.5 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.75 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.47 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  34.18 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.58 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.66 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.98 
 
 		 293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.07 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  34.9 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.11 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  32.67 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>