More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1188 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 350 aa  705    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  48.84 
 
 		 559 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  32.7 
 
 		 308 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  34.51 
 
 		 296 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  35.07 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  32.12 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  33.94 
 
 		 296 aa  124  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  32.2 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  32.86 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  31.54 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  31.53 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  33.79 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  32.88 
 
 		 301 aa  109  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  28.57 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  27.84 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  28.21 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  26.26 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  26.69 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1978  dihydrodipicolinate synthetase  27.34 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040747 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.97 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.53 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  27.8 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.47 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.45 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  26.62 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.14 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  27.35 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  28.34 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  26.01 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  25.37 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  26.83 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  26.42 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  28.28 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  24.32 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  26.48 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.63 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  28.32 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  26.78 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  26.7 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  26.01 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  26.8 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 291 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  26.03 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.82 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  27.02 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  28.51 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  26.17 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  25.42 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  26.51 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  27.54 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  25.32 
 
 		 304 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  26.14 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  23.33 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  24.28 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  23.33 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  24.28 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>