More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3294 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  62.59 
 
 
296 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  59.86 
 
 
308 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  59.71 
 
 
308 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  59.33 
 
 
308 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  53.95 
 
 
297 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  58.96 
 
 
295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  51.36 
 
 
297 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  51.7 
 
 
297 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  50.34 
 
 
297 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  44.9 
 
 
306 aa  216  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  45.15 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  47.32 
 
 
296 aa  205  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  36.24 
 
 
559 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  39.26 
 
 
301 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 
350 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  33.86 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 
294 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  31.29 
 
 
296 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 
298 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.66 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 
292 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.79 
 
 
293 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
297 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  31.29 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  33.96 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 
294 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 
299 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.14 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 
292 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
293 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 
292 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  31.43 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.47 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  32.37 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  29.15 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 
295 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.69 
 
 
295 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
298 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 
298 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 
298 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 
298 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  32.04 
 
 
302 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 
294 aa  112  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.91 
 
 
295 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  34.52 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  28.91 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 
323 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 
298 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.05 
 
 
291 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 
298 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 
290 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  31.9 
 
 
295 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 
287 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
298 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
292 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 
298 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 
298 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  31.28 
 
 
297 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.84 
 
 
298 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 
300 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 
297 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 
292 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 
292 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>