More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1329 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  58.64 
 
 
296 aa  329  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  54.61 
 
 
308 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  59.79 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  58.36 
 
 
297 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  56.12 
 
 
297 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  55.8 
 
 
308 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  57.36 
 
 
308 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  56.38 
 
 
299 aa  264  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  54.68 
 
 
297 aa  255  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  45.89 
 
 
296 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  52.28 
 
 
296 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  48.54 
 
 
306 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  37.33 
 
 
559 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  42.96 
 
 
301 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  35.02 
 
 
350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  35.19 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  35.04 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  32.36 
 
 
298 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.76 
 
 
304 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  33.76 
 
 
304 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.24 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 
292 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
297 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  33.72 
 
 
303 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 
298 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 
292 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  34.77 
 
 
296 aa  122  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  32.09 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  33.08 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.83 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
298 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
298 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
298 aa  119  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
293 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.43 
 
 
298 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
297 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  27.89 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 
297 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  35.64 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
298 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 
290 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
298 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 
293 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 
320 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
298 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.23 
 
 
294 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  29.43 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 
292 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  33.72 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.9 
 
 
295 aa  115  8.999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
298 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 
297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  26.69 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.33 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 
295 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 
295 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 
292 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 
294 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 
298 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 
294 aa  112  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  34.2 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>