More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09540 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09540  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 
301 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.345365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1901  dihydrodipicolinate synthetase  48.66 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2014  dihydrodipicolinate synthetase  50.34 
 
 
306 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1729  dihydrodipicolinate synthetase  47.65 
 
 
296 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426796  normal  0.609596 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4167  dihydrodipicolinate synthetase  41 
 
 
296 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.290028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1329  dihydrodipicolinate synthetase  43.48 
 
 
295 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5078  dihydrodipicolinate synthetase  38.59 
 
 
308 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0707  dihydrodipicolinate synthetase  42.95 
 
 
297 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168869  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0696  dihydrodipicolinate synthetase  42.76 
 
 
297 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1020  dihydrodipicolinate synthetase  44.41 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.136633  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5643  dihydrodipicolinate synthetase  41 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21260  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  40.61 
 
 
559 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.175534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2534  dihydrodipicolinate synthetase  40.69 
 
 
308 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3294  dihydrodipicolinate synthetase  39.86 
 
 
299 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2793  dihydrodipicolinate synthetase  41.82 
 
 
308 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1188  dihydrodipicolinate synthetase  32.88 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0108219  normal  0.0299007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  28.66 
 
 
290 aa  99.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  30.92 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  31.6 
 
 
294 aa  92  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.43 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.81 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.26 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.33 
 
 
298 aa  89.7  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.36 
 
 
297 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 
298 aa  89  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.29 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  27.54 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.62 
 
 
293 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  28.62 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1006  putative dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1958  dihydrodipicolinate synthase, putative  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1160  DapA_1  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0869  putative dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0279  putative dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0518166  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0999  putative dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0956  putative dihydrodipicolinate synthase  36.67 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2860  hypothetical protein  32.67 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  37.91 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  37.91 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  37.25 
 
 
295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  35.45 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  35.45 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  28.9 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  24.46 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  38.46 
 
 
298 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0566089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.89 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4823  dihydrodipicolinate synthetase  30.15 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0718726  normal  0.342199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  26.5 
 
 
298 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4773  dihydrodipicolinate synthetase  31.35 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  26.5 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  31.15 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  30.53 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  26.61 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  27.05 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  25.94 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  29.32 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  27.27 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  26.33 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6692  dihydrodipicolinate synthetase  31.37 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  31.3 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  26.62 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  31.43 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  27 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1978  dihydrodipicolinate synthetase  34.42 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.35 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  24 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  31.02 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  24.91 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  30.73 
 
 
304 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  26.56 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>