More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4989 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  96.99 
 
 		 299 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  96.32 
 
 		 299 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  96.66 
 
 		 299 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  96.66 
 
 		 299 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  81.61 
 
 		 299 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 		 299 aa  494  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.12 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3999  dihydrodipicolinate synthetase  90.48 
 
 		 96 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  29.31 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.8 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 326 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.1 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 290 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  31.76 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.96 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  29.51 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.85 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  37.68 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  29.93 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  29.56 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  27.4 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  31.1 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.4 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  34.15 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.08 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  31.21 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.46 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>