More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08330 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  100 
 
 		 317 aa  623  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  54.28 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  51.8 
 
 		 315 aa  325  9e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  57.88 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  52.29 
 
 		 307 aa  318  7.999999999999999e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  54.43 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  54.43 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  54.34 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  50.32 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  50.17 
 
 		 305 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  50.5 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  50.16 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  47.88 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  46.2 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  33.73 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  26 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.61 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  25.82 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  25.82 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  25.82 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  27.56 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  25.49 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1536  dihydrodipicolinate synthetase  31.54 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.619521 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  27.74 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  29.7 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23290  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0408468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.47 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  30.27 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  25.99 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  31.13 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.67 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  31.67 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  31.67 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.67 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.05 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.67 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  28.31 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  25.44 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  29.14 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  30.19 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.09 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.48 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  27.06 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  28.48 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  26.32 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>