More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3771 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 328 aa  633  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  57.88 
 
 		 317 aa  315  6e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  48.85 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  49.19 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  48.85 
 
 		 315 aa  280  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.17 
 
 		 320 aa  277  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  49.33 
 
 		 307 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  48.18 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  48.18 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  47.19 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  50.66 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  47.73 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  50.99 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  42.72 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.41 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.37 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  32.89 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 371 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.12 
 
 		 326 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  31.99 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.77 
 
 		 302 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  31.27 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  32.48 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  28.29 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  27.96 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  27.96 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  27.96 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.33 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  29.96 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  28.23 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.29 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  31 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.82 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  30.07 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 292 aa  119  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.55 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30.67 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  28.41 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  30.83 
 
 		 291 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.66 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  29 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  27.45 
 
 		 305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  28.07 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  27.7 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  32.44 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  28.29 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  29.2 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  30.83 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  34.07 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  34.76 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 293 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  26.07 
 
 		 298 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  28.11 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  28.15 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  33.48 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>