More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3733 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  99.67 
 
 
301 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
301 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  51.86 
 
 
303 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  43.19 
 
 
305 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  44.76 
 
 
302 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  44.06 
 
 
302 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  42.28 
 
 
301 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 
297 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
301 aa  159  4e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
298 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
298 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
298 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 
298 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
291 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.65 
 
 
313 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  155  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
298 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  29.68 
 
 
302 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 
298 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 
293 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 
294 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 
298 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 
293 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 
298 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
326 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 
298 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.07 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
300 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
292 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 
300 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 
291 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 
291 aa  143  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 
294 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 
292 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.96 
 
 
292 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.83 
 
 
293 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  33.06 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  31.29 
 
 
287 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.96 
 
 
294 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 
292 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
294 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 
299 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 
304 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 
309 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 
301 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 
300 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  32.32 
 
 
307 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 
296 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 
294 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.57 
 
 
298 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.42 
 
 
371 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  28.19 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 
300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.92 
 
 
292 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  30.82 
 
 
309 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 
297 aa  135  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  32.01 
 
 
292 aa  135  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  31.13 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
294 aa  133  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 
294 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.19 
 
 
301 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  30.79 
 
 
294 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
298 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
291 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
291 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.55 
 
 
295 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  32.23 
 
 
319 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>