More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1265 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  39.46 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  38.15 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  37.41 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  34.05 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 301 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  31.51 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  28.18 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.49 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.15 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 298 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.34 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.77 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  33.64 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  33.64 
 
 		 316 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  33.64 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  33.66 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  33.66 
 
 		 293 aa  122  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.65 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.81 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 		 314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  27.5 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.3 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  26.59 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3989  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  29.73 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  28.82 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  26.5 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.03 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  29.5 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  26.13 
 
 		 371 aa  115  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.83 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  32.37 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  32.37 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.23 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  30.2 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  29.8 
 
 		 297 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.12 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>