More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3799 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  99.67 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  99.67 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  99.67 
 
 		 301 aa  620  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  51.53 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  42.86 
 
 		 305 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  45.1 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  44.41 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  41.95 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  33.56 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.65 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  28.84 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  29.33 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.43 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.07 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  28.96 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  29.35 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  29.25 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  30.95 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  30.92 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  29.53 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  31.31 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.19 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  32.92 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.53 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 292 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  27.85 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.65 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  30.64 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  30.49 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.19 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.55 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  30.79 
 
 		 319 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  27.03 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  30.46 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.11 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  26.87 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  31.89 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>