More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1063 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  39.46 
 
 		 297 aa  225  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  32.26 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  32.03 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  29.01 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  29.07 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  26.55 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  26.55 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  26.55 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  26.55 
 
 		 301 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.68 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.68 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  29.89 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.43 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  29.45 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  30.49 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.87 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 		 289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  28.02 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  27.43 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  29.67 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  27.92 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  29.46 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.85 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.69 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.05 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  30.54 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  31.78 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  26.76 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  31.66 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  26.92 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  23.69 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  23.34 
 
 		 298 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  28.22 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>