More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2960 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  44.09 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  45.85 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  42.24 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  41.18 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  40.28 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  40.58 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  41.88 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  37.37 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.93 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 295 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  39.58 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  36.65 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  38.69 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  38.32 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  37.55 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  36.79 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  37.17 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  40.71 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  36.56 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  37.99 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  38.29 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.74 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.8 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 289 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  36.56 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  35.16 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  35.61 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  30.47 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  35.38 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  37.46 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  35.14 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  35.14 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  34.86 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1626  dihydrodipicolinate synthase  35.62 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0389231  hitchhiker  0.0000523491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  35.11 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  35.69 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  32.74 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  34.31 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>