More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2140 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  98.26 
 
 		 288 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  92.23 
 
 		 289 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  55.94 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  49.82 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  47.86 
 
 		 302 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3191  dihydrodipicolinate synthetase  92.03 
 
 		 189 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.423646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  47.26 
 
 		 307 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  50.36 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  45.77 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  47.21 
 
 		 302 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  44.6 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  47.86 
 
 		 318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  41.52 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  40.97 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.51 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  38.89 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  37.63 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  39.48 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  37.76 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30.31 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  38.11 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 303 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  31.27 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  30.93 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1762  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.48 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  35.56 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  31.53 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5807  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 293 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.22 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10460  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184566  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  31.51 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>