More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2195 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 300 aa  600  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  64.41 
 
 		 331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  57.79 
 
 		 307 aa  318  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  57.75 
 
 		 302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  57.09 
 
 		 307 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  63.08 
 
 		 311 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 294 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  61.79 
 
 		 318 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  54.3 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  55.67 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  53.55 
 
 		 287 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  50.36 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  50.53 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  56.41 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  46.38 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  44.2 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 297 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  45.65 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 297 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  41.88 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  40.67 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  44.77 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  45.49 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  39.22 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  35.23 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 293 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  36.62 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  33.81 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.85 
 
 		 295 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 295 aa  148  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  35.53 
 
 		 293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>