More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6298 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  95.62 
 
 		 297 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  94.95 
 
 		 297 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  94.95 
 
 		 297 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  92.59 
 
 		 297 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  95.12 
 
 		 297 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  87.76 
 
 		 299 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  78.37 
 
 		 295 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  78.6 
 
 		 298 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  78.6 
 
 		 298 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  78.25 
 
 		 300 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  51.4 
 
 		 307 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  50.34 
 
 		 307 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  47.9 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 302 aa  238  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  46.38 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  45.8 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  47.84 
 
 		 318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  40.43 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  39.51 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 290 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  38.71 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  37.06 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  38.95 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  36.88 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.36 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  38.08 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  34.51 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  36.2 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  35.51 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  35.76 
 
 		 300 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  37.01 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  36.23 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 307 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4361  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.99 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2201  dihydrodipicolinate synthase  33.77 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  34.01 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  33 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>