More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0966 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 305 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  71.57 
 
 		 303 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  44.04 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  43.06 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  43.77 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  40.67 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  39.65 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  40.77 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  40.49 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  34.81 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 292 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  36.86 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  34.18 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  40.7 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  38.54 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.71 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  34.3 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  38.05 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  35.1 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  32.55 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  38.28 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  38.24 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.9 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  32.18 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  32.49 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  34.41 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.96 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0784  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  35.31 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  36 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  36.73 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.48 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  32.61 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>