More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2222 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  591  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  56.69 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  55.94 
 
 		 288 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  55.24 
 
 		 288 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  50.33 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  53.79 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  50.52 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  47.7 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  50.18 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  45.3 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  45.64 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  39.08 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  39.04 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  37.41 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  38.68 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  37.98 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  37.28 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  35.69 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.97 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  38.66 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  37.36 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  34.71 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.76 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  34.23 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 		 291 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  39.3 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  38.66 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  30.5 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3944  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  165  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  33 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0065  dihydrodipicolinate synthase  35.99 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  34.44 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  36.01 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25250  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  36.49 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 293 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  36.6 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  36.03 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.91 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2144  dihydrodipicolinate synthase  37.25 
 
 		 327 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00221445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>