More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2107 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  100 
 
 		 307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  88.27 
 
 		 307 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  69.66 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  57.73 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  57.19 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  55.59 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  55.59 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  50.33 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  54.42 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  54.93 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  48.81 
 
 		 289 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 288 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  48.84 
 
 		 297 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  50.34 
 
 		 297 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  55.48 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  50.17 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  46.98 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  47.19 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  47.04 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  47.4 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  40.83 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  46.82 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  44.04 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  35.47 
 
 		 290 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  34.9 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.56 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  36.05 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.23 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  35.42 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  34.46 
 
 		 332 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  31.76 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.86 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  31.74 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  36.17 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0670  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.08 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  36.36 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  37.24 
 
 		 293 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  35.1 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  33.89 
 
 		 291 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  36.05 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  36.61 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  37.23 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  34.95 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  39.38 
 
 		 288 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  34.86 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  34.03 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  39.71 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  35.03 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  31.83 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.14 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  31.79 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.42 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>