More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1875 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 288 aa  584  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 		 294 aa  329  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  54.76 
 
 		 294 aa  328  8e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  52.92 
 
 		 304 aa  322  4e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  51.04 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 		 296 aa  244  8e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 		 290 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  42.61 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  43.64 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  38.97 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  39.08 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  39.52 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  41.18 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 296 aa  232  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 292 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  43.26 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  41.26 
 
 		 291 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 292 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.46 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 290 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  39.29 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 295 aa  225  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  39.16 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  42.31 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0897  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0827  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.179848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1058  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  38.62 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  37.59 
 
 		 292 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.44 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 293 aa  211  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  39.78 
 
 		 289 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  42.2 
 
 		 293 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 299 aa  211  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  37.88 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  42.49 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  37.54 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  38.6 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  39.18 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  38.7 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  40.21 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  38.36 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  37.8 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 292 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  38.01 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  38.83 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 		 289 aa  208  7e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  37.33 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>