More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0029 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  53.47 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  53.47 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  44.09 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  41.2 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  42.65 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  40.27 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  38.99 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  38.19 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  38.71 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 288 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  36.52 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  39.57 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  36.62 
 
 		 331 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  40.5 
 
 		 299 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  38.71 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  41.07 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  37.04 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.93 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.77 
 
 		 290 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  34.52 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  35.29 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.45 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  38.11 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 294 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  34.27 
 
 		 293 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.44 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  33.82 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  35.82 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  35.55 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  32.35 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  32.72 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  33.07 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  33.07 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3237  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115638  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.51 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  33.46 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.55 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.22 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  28.17 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  30.22 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  27.78 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>