More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0665 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0665  dihydrodipicolinate synthase-like transmembrane protein  100 
 
 		 304 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  80.59 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  80.92 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1836  dihydrodipicolinate synthetase  57.71 
 
 		 331 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0666  dihydrodipicolinate synthase  57.34 
 
 		 302 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390614  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  54.42 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  55.87 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  53.02 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1243  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323675  hitchhiker  0.00715557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2195  dihydrodipicolinate synthase  56.41 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00262069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  44.6 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5213  dihydrodipicolinate synthase  51.52 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  45.2 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2993  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2856  dihydrodipicolinate synthase  46.15 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.863672 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6298  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.8 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0382  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0367  dihydrodipicolinate synthase  45.16 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2332  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0502282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2946  dihydrodipicolinate synthase  45.45 
 
 		 297 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0557  dihydrodipicolinate synthase  44.8 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2967  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2941  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2960  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  35.17 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  38.11 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0029  putative dihydrodipicolinate synthase  38.11 
 
 		 294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  37.5 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  32.64 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2365  dihydrodipicolinate synthase  40.14 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 		 314 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  39.16 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 292 aa  146  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.02 
 
 		 289 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  31.77 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  36.54 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  32.54 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.34 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  32.28 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  33.58 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.71 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.73 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  33.96 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  31.14 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  30.68 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  32.71 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>