More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6246 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  52.8 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1194  dihydrodipicolinate synthase  52.35 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  hitchhiker  0.000799009 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  36.46 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1790  dihydrodipicolinate synthase  36.11 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  39.38 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2222  dihydrodipicolinate synthase  36.6 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  35.87 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  35.38 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  36.55 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  38.75 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  40.93 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 295 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0609  dihydrodipicolinate synthase  38.27 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0557  dihydrodipicolinate synthase  37.91 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13384  normal  0.786479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 293 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  34.31 
 
 		 301 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  34.42 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  34.66 
 
 		 292 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  35.19 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  31.71 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  34.42 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  34.67 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  36.24 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0966  dihydrodipicolinate synthase  37.99 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6805  dihydrodipicolinate synthase  38.06 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.591839 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  31.99 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.21 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  33.58 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2769  dihydrodipicolinate synthase  38.13 
 
 		 296 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6633  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4525  dihydrodipicolinate synthase  35.9 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3193  dihydrodipicolinate synthase  37.01 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2639  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  34.88 
 
 		 300 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  32.26 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  36.96 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  33.93 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  33.95 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  31.03 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.8 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  34.06 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  32.97 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  32.98 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  34.07 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.16 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2140  dihydrodipicolinate synthase  38.11 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  31.09 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0774  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.392848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.09 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  32.85 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 		 287 aa  142  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  32.48 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1226  dihydrodipicolinate synthase  32.84 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  34.81 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.02 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>