More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2135 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2135  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  564  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6246  dihydrodipicolinate synthase family protein  52.8 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1194  dihydrodipicolinate synthase  50.9 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  hitchhiker  0.000799009 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  36.95 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2107  dihydrodipicolinate synthase family protein  42.81 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  36.15 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  37.77 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  36.2 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  37.96 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09438  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  35.02 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  35.93 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  37.32 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  36.61 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  35.59 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 294 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  35.35 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  35.35 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  36.96 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  35.35 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  35.35 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  36.59 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  34.35 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  36.33 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 294 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  35.49 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  36.1 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  37.45 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.63 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  38.14 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  37.05 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5899  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.48901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  36.81 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  36.56 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 		 294 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  35.03 
 
 		 292 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  37.2 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  35.77 
 
 		 294 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4731  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0522382  normal  0.189111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  33.69 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  38.52 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  35.94 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  33.79 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  35.69 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  37.29 
 
 		 326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  35.05 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  35.49 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  36.69 
 
 		 296 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  34.8 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  35.15 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  35.37 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  34.05 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0323  dihydrodipicolinate synthase  38.49 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  34.67 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  36.3 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  35.89 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>