More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0184 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
309 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  87.38 
 
 
309 aa  527  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  50.16 
 
 
305 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  50.81 
 
 
305 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  50.8 
 
 
309 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  50 
 
 
305 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  50 
 
 
320 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  49.02 
 
 
307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  49.84 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  49.03 
 
 
328 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  47.73 
 
 
330 aa  269  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  47.25 
 
 
315 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  45.69 
 
 
316 aa  245  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  43.87 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 
301 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 
301 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  31.63 
 
 
301 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  31.31 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  29.24 
 
 
293 aa  130  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  27.63 
 
 
289 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  33.87 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  30.51 
 
 
303 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 
291 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 
298 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.68 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.91 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  29.22 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  31.03 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  28.71 
 
 
298 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  29.07 
 
 
289 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  35.2 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  27.3 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.97 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  31.23 
 
 
294 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.24 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
301 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  29.84 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  29.52 
 
 
298 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  32.48 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1529  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  28.86 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  30.52 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  25.66 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.57 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  25.26 
 
 
292 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  25.6 
 
 
292 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  28.89 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
296 aa  113  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  28.81 
 
 
302 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
300 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3470  dihydrodipicolinate synthase  27.95 
 
 
293 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  28.66 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  27.04 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.29 
 
 
313 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
295 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
294 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  29.08 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.91 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>