More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4793 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
305 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  93.11 
 
 
305 aa  591  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  78.36 
 
 
305 aa  504  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  78.36 
 
 
320 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  50.16 
 
 
309 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  48.34 
 
 
307 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  49.83 
 
 
309 aa  275  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  49.5 
 
 
317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  43.79 
 
 
315 aa  269  5e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  47.19 
 
 
328 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  47.56 
 
 
309 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  41.18 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  45.36 
 
 
303 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  44.05 
 
 
316 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  33.76 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  32.81 
 
 
303 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.07 
 
 
313 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  34.17 
 
 
298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  30.62 
 
 
293 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  30.13 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  33.75 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.36 
 
 
308 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.69 
 
 
290 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 
302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.18 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 
298 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 
291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  33.47 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 
298 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  27.36 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  27.52 
 
 
291 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 
288 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.71 
 
 
305 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 
292 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 
296 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2538  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
298 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.127413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 
292 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  25.08 
 
 
292 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 
292 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  29.74 
 
 
296 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  26.6 
 
 
291 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  32.91 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  29.19 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  26.32 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  28 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  28.1 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  28.1 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  25.67 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  28.1 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 
298 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 
293 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  27.27 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  28.25 
 
 
294 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 
292 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 
296 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  27.78 
 
 
301 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  28.67 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  28.63 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  27.55 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  26.33 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.25 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  28.38 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  30.65 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  30.94 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  34.71 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
294 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 
301 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 
294 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
293 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  28.78 
 
 
301 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  27.97 
 
 
296 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  28.85 
 
 
293 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 
300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 
300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  30.69 
 
 
303 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  27.81 
 
 
300 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>