More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1435 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1435  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
316 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  48.52 
 
 
309 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0184  dihydrodipicolinate synthase  45.69 
 
 
309 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3771  dihydrodipicolinate synthetase  50.99 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  47.88 
 
 
303 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0406  dihydrodipicolinate synthase family protein  45.42 
 
 
305 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0349  dihydrodipicolinate synthase family protein  45.42 
 
 
320 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  46.01 
 
 
309 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  44.05 
 
 
305 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08330  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  47.88 
 
 
317 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.366488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2150  dihydrodipicolinate synthetase  43.23 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4685  dihydrodipicolinate synthetase  42.12 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828547  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06720  dihydrodipicolinate synthase/N-acetylneuraminate lyase  39.94 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.159669  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0929  dihydrodipicolinate synthetase  43.49 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.568933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  37.7 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  37.7 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  37.7 
 
 
298 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  37.7 
 
 
298 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.19 
 
 
313 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  37.3 
 
 
298 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.96 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1897  dihydrodipicolinate synthase  39.36 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  34.43 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1836  dihydrodipicolinate synthase  38.96 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00126  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 
302 aa  136  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  31.8 
 
 
291 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  34.96 
 
 
298 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  34.1 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  33.77 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.05 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  32.72 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 
291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  33.07 
 
 
292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  30.13 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.65 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  33.48 
 
 
292 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  31.58 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  33.19 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0522  dihydrodipicolinate synthetase  33.07 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000192059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  29.81 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.87 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  30.8 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  34.16 
 
 
296 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 
303 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 
291 aa  125  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  34.09 
 
 
293 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
291 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  31.3 
 
 
294 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
371 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07150  dihydrodipicolinate synthase  33.55 
 
 
305 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.152758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  30.89 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  31.37 
 
 
326 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
289 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  32.02 
 
 
301 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2117  dihydrodipicolinate synthetase  43.18 
 
 
290 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277384  normal  0.880374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  38.92 
 
 
301 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  29.47 
 
 
290 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  32.38 
 
 
301 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  28.29 
 
 
305 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 
301 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 
301 aa  123  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  31.18 
 
 
300 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  27.12 
 
 
294 aa  123  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.33 
 
 
297 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 
292 aa  123  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  30.51 
 
 
302 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 
301 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  29.7 
 
 
308 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3581  dihydrodipicolinate synthetase  30.43 
 
 
286 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  30.56 
 
 
294 aa  122  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  32.79 
 
 
294 aa  122  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  34.84 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  28.1 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  34.85 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  29.55 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  32.1 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  35.74 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2052  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
289 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0341235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  26.77 
 
 
297 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  33.12 
 
 
303 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  28.28 
 
 
297 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.89 
 
 
294 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1454  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000582626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  37.35 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  28.06 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1511  dihydrodipicolinate synthase  38.71 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>