More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3219 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3219  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
298 aa  592  1e-168  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1287  dihydrodipicolinate synthetase  64.72 
 
 
308 aa  362  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0556  dihydrodipicolinate synthetase  47.78 
 
 
301 aa  237  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2117  dihydrodipicolinate synthetase  46.15 
 
 
290 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277384  normal  0.880374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 
294 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  35.15 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 
290 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.19 
 
 
290 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  34.38 
 
 
296 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  38.57 
 
 
290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  34.67 
 
 
291 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  40.27 
 
 
301 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  34.29 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 
291 aa  153  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  34.91 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  34.72 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  34.31 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 
298 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
303 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
290 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  37.02 
 
 
314 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  36.04 
 
 
300 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 
290 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  37.67 
 
 
291 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  38.29 
 
 
292 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 
296 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  31.07 
 
 
297 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  34.02 
 
 
298 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  34.6 
 
 
290 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
298 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 
309 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3319  dihydrodipicolinate synthase  32.88 
 
 
293 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.343226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  35.25 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  34.38 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 
290 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 
292 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  32.53 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  37.22 
 
 
292 aa  145  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  32.2 
 
 
296 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  35.71 
 
 
292 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
292 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  33.66 
 
 
297 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  32.62 
 
 
294 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6099  dihydrodipicolinate synthetase  37.46 
 
 
303 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2548  Dihydrodipicolinate synthase  35.13 
 
 
371 aa  143  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 
297 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.37 
 
 
308 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  36.94 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.25 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  34.69 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  26.88 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 
301 aa  140  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  36.99 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  33.04 
 
 
294 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 
290 aa  139  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  29.21 
 
 
289 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1485  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 
295 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  29.29 
 
 
289 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1456  dihydrodipicolinate synthase  32.07 
 
 
295 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  32.87 
 
 
306 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 
296 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2475  putative dihydropicolinate synthase family protein  37.54 
 
 
309 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0884087  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  34.11 
 
 
294 aa  137  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 
293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.15 
 
 
297 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.1 
 
 
313 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0999  dihydrodipicolinate synthase  28.68 
 
 
288 aa  136  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 
301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  38.63 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  34.97 
 
 
308 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2280  dihydrodipicolinate synthetase  37.79 
 
 
306 aa  135  8e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0107583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  34.55 
 
 
292 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  30.32 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  33.83 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.52 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  32.78 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  31.39 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  31.01 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>