More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8494 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8494  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515104  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  65.89 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2368  dihydrodipicolinate synthetase  69.55 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4876  dihydrodipicolinate synthetase  57.04 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.389418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4686  dihydrodipicolinate synthetase  40.99 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  36.18 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.69 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  35.92 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  36.15 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  34.83 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.65 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  36.03 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  33.92 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  36.14 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  35.79 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  35.07 
 
 		 293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  34.27 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  36.06 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2643  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2614  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2658  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  36.06 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 293 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  34.62 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  35.48 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  34.28 
 
 		 292 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.17 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  30.82 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  32.16 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  36.06 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  35.04 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0868  dihydrodipicolinate synthase  35.66 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0546543  normal  0.136801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0354  dihydrodipicolinate synthase  35.44 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  32.34 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  35.38 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1611  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  35.77 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  36.43 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  32.95 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  35 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  36.62 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  34.22 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  30.45 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  31.97 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  34.53 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  32.73 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.6 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  34.11 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  34.75 
 
 		 296 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  36.58 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  34.48 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.03 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  31.6 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 		 298 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  32.51 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  32.6 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  34.57 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1312  dihydrodipicolinate synthase  29.23 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.344915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  32.63 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1365  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00312051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  30.53 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  33.57 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5112  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7523  dihydrodipicolinate synthase  34.84 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  32.75 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0615  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  31.49 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>