More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3171 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  77.96 
 
 		 309 aa  479  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  75.16 
 
 		 314 aa  472  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  72.76 
 
 		 307 aa  438  9.999999999999999e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  70.63 
 
 		 332 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  52.1 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  55.24 
 
 		 291 aa  315  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  54.01 
 
 		 291 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  53.57 
 
 		 291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  50.35 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  52.6 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 291 aa  287  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  46.92 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  45.67 
 
 		 290 aa  264  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 289 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  48.8 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  43.79 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.33 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  44.79 
 
 		 289 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  253  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  47.22 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  45.07 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  43.9 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  45.23 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  44.98 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.76 
 
 		 292 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  39.86 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.56 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  42.01 
 
 		 290 aa  235  7e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  42.32 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  43.75 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  47.77 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3607  dihydrodipicolinate synthase  42.81 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  43.25 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.11 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  44.29 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  40.56 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  42.86 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 291 aa  225  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  43.18 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  40.34 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  41.61 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  41.41 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  43.21 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  41.81 
 
 		 293 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.21 
 
 		 300 aa  222  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 292 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  37.46 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  39.63 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_846  dihydrodipicolinate synthase  43.07 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0973  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  39.66 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  42.75 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  40.62 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  41.67 
 
 		 299 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.09 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  38.41 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1138  dihydrodipicolinate synthase  39.38 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.635374  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  44.57 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0864  dihydrodipicolinate synthase  42.7 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  41.1 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  44.57 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  38.38 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1306  dihydrodipicolinate synthase  39.24 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>