More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0530 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0530  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 297 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.4261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  53.54 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  55.07 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  52.38 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  51.92 
 
 		 291 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  48.31 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  49.83 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  47.3 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  48.66 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  44.75 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  46.46 
 
 		 291 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  44.78 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  44.78 
 
 		 290 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 		 292 aa  252  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  45.64 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.44 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  43.77 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.59 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.13 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  43.54 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  42.95 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.2 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  42.52 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  41.95 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  43.34 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  42.25 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  41.84 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  41.08 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  42.42 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 		 291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  41.64 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  41.14 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.4 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  41.89 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  41.28 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  40.4 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  38.93 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  40.94 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  39.39 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  40.55 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  39.12 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  39.73 
 
 		 294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  42.07 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 294 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  41.01 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  40.61 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  40.75 
 
 		 319 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 292 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  41.43 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  39.93 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  40.85 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3191  dihydrodipicolinate synthase  40.41 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0102406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  40.27 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  42.03 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  39.53 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  41.79 
 
 		 296 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  39.53 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  38.98 
 
 		 291 aa  215  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  38.91 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  36.82 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  40.07 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  41.38 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  40.49 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  41.58 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  39.25 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1204  dihydrodipicolinate synthase  40 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  39.59 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  38.85 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  38.23 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  40.48 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  39.53 
 
 		 292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  42.09 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>